La misión del Gimnasio Moderno es educar integralmente a los estudiantes, permitir que los niños y los adolescentes encuentren en el colegio su luz propia. Su visión es que este ambiente de confianza y libertad, creatividad, amor al conocimiento y al esfuerzo personal, al compañerismo y la autonomía, al intercambio con el mundo y al conocimiento de su país, les permitan a nuestros egresados ser líderes en la universidad y en sus vidas, destacarse en la sociedad como ejemplos de libertad y honestidad, como personas capaces de construir junto a otros la innovación y la democracia donde quiera se encuentren.

Para esta formación integral nuestros estudiantes pasan por un camino de catorce años, donde las áreas y las secciones trabajan intensamente junto a ellos para su desarrollo y sus aprendizajes. El Gimnasio Moderno tiene cuatro secciones: el Preescolar, que va desde Montessori I a Primero; la Primaria, que va de Segundo a Quinto grados; el Bachillerato, de Sexto a Noveno grados; y finalmente, la Cuarta Sección o Semestralización, que abarca los dos últimos grados, décimo y once. Con excepción de la Cuarta, cada Sección comprende cuatro años. Este camino tiene a su vez un desarrollo transversal a cargo de las áreas del conocimiento, encargadas de estructurar el aporte de estas disciplinas al nivel que estén cursando los niños y los adolescentes.

El esfuerzo está en lograr una articulación cada vez más armónica entre las secciones, pues el objetivo final es el desarrollo del niño o el adolescente. Así mismo, las áreas, más que disciplinas cerradas, en una Pedagogía por Proyectos cumplen más la función de ejes o interlocutores en un diálogo abierto.